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sexta-feira, 16 de novembro de 2012

Fiocruz cria banco de dados sobre bactérias da Mata Atlântica



A Coleção de Bactérias da Mata Atlântica, CBMA, situa-se no Laboratório de Genética Molecular de Micro-organismos do Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, e tem como finalidade: amostrar, isolar, preservar e caracterizar a diversidade de bactérias cultiváveis do solo da Mata Atlântica. Representa a fonte primária de parte da microbiota deste bioma para estudos básicos e biotecnológicos e, como Coleção, é testemunho destes estudos, permitindo sua rastreabilidade. Como sua taxonômia é definida pela informação contida no gene ribossomal 16S rRNA, e estas sequências podem ser livremente acessadas, são inúmeras as possibilidades de estudos.

Trata-se de uma Coleção de serviço e pesquisa. A CBMA é filiada à World Federation for Culture Collections, WFCC, sob o registro WDCM958.

Até o presente o acervo da CBMA contém 800 isolados correspondendo a 100 morfotipos obtidos nos oito pontos de coleta representados pelos cinco tipos de solo.

A identificação dos primeiros 100 isolados, baseada no gene ribossomal 16S rRNA e na comparação das sequências (~1300pb) com as referências do projeto de banco de dados ribossomal (RDP - Ribosomal Database Project), definiu a presença dos seguintes gêneros de bactérias: Acinetobacter, Amycolatopsis, Arthrobacter, Bacillus, Burkholderia, Collimonas, Cupriavidus, Dyella, Enterobacter, Klebsiella, Leifsonia, Mycobacterium, Paracoccus, Paenibacillus, Phyllobacterium, Pseudomonas, Ralstonia, Serratia, Silvimonas, Streptomyces e Variovorax

com EBC

segunda-feira, 29 de agosto de 2011

UNIARP incentiva criação de banco de dados sobre biodiversidade



A Universidade Alto Vale do Rio do Peixe (UNIARP) através dos acadêmicos bolsistas Cassio Geremia Freire, Maria Fabíola Ribeiro dos Santos e Marizete Müller, do curso de Ciências Biológicas e Roger Campos, do curso de Engenharia Ambiental, está desenvolvendo o projeto científico “Biblioteca virtual de dados sobre fungos ectomicorrízicos - Hymenomycetes - em Pinus taeda e Briófitas na região de Caçador-SC”.


O projeto tem como principal objetivo a armazenagem de informações científicas das diversas espécies encontradas no município de Caçador, visando a criação de um banco de conhecimentos da biodiversidade local.


As atividades são orientadas por professores da área de microbiologia e botânica da UNIARP.


Exemplares de espécies botânicas estão sendo coletadas e fotografadas em áreas pré-determinadas. Além disso, as características do local e do exemplar são descritas em fichas padronizadas de coleta. Posteriormente, são realizadas diversas análises macroscópicas e microscópicas no laboratório da UNIARP, bem como testes químicos.


Os resultados destas análises são comparadas e revisadas em literatura especializada para que, então, a identificação e a classificação dos espécimes coletados sejam realizadas.


O projeto tem apoio do Fundo de Apoio a Pesquisa da UNIARP. Inicialmente, o projeto abrange o levantamento de gêneros pertencentes à Classe Hymenomycetes - cogumelos típicos - em áreas de plantio de pinus e Briófitas - espécies comparativas a musgos - coletadas na região do município de Caçador-SC.


O intuito é de ampliar o projeto para que grande parte da flora local seja catalogada e que as informações próprias permaneçam em um histórico organizado. Com isto, a biblioteca virtual poderá ser utilizada como base para diversos trabalhos científicos da área, ampliando e disseminando o conhecimento botânico.


HERBÁRIO BIOVIRTUAL


O blog Herbário Biovirtual é uma extensão do projeto Biblioteca Virtual de Dados Sobre Briófitas e Pteridófitas na Região de Caçador - SC.


O projeto surgiu devido à carência de dados referentes ao estudo de briófitas e pteridófitas da região, sendo que o objetivo é criar um banco de dados, baseados em imagens fotográficas dos espécimes encontrados e fichas de coleta, ou seja, coletar, descrever e fotografar os principais grupos encontrados de briófitas e pteridófitas na margem Rio do Peixe na região central da cidade de Caçador.


No blog o público em geral poderá estar acompanhando o que está sendo realizado pela equipe e, consequentemente ter acesso a todas as informações obtidas no decorrer da pesquisa.


A equipe é formada pela professora orientadora Débora Ceretta Jung e os acadêmicos voluntários, Alex Guilherme Lopes Scotti, Maria Fabíola Ribeiro dos Santos e Marizete Müller, todos acadêmicos da 4ª fase do curso de Ciências Biológicas da UNIARP. O blog pode ser acessado pelo site http://herbariobiovirtualuniarp.webnode.com.br/ 


Fonte: Planeta Universitário